水稻(Oryza sativa L.)生產(chǎn)是保證人類糧食安全的首要任務(wù)。提高糧食產(chǎn)量的途徑之一是延緩葉片衰老,并延長(zhǎng)光合作用時(shí)間。MicroRNAs(miRNAs)是真核生物衰老和細(xì)胞衰老的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。近日杭州師范大學(xué)沈波教授的團(tuán)隊(duì)攜手中國(guó)水稻研究所莊杰云教授的團(tuán)隊(duì)系統(tǒng)研究了miRNAs在水稻葉片衰老過(guò)程中發(fā)揮的作用*,研究成果發(fā)表在12月刊的PLoS ONE上。
科研人員采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)兩個(gè)不同株系的超級(jí)雜交稻(N2Y6,抗衰老稻和LYP9,易衰老稻)葉片構(gòu)建并測(cè)定了6個(gè)小RNA文庫(kù),6個(gè)DGE文庫(kù),和2個(gè)降解組文庫(kù)(小RNA測(cè)序,DGE測(cè)序和降解組測(cè)序項(xiàng)目均由聯(lián)川生物承擔(dān)完成)。 接著基于這些測(cè)序數(shù)據(jù),對(duì)兩個(gè)不同品種的雜交稻的miRNA和其靶基因進(jìn)行深入分析。實(shí)驗(yàn)共鑒定出,372個(gè)已知miRNAs,162個(gè)候選miRNAs,和1145個(gè)miRNA靶基因。相比于LYP9葉片中miRNA的表達(dá),在N2Y6葉片中,在灌漿初期分別有47個(gè)和30個(gè)miRNAs,在中期分別有21和17個(gè)miRNAs,在后期分別有11和37個(gè)miRNAs出現(xiàn)上調(diào)和下調(diào)。鑒定出6個(gè)miRNA家族,osa-miR159,osa-miR160,osa-miR164,osa-miR167,osa-miR172和osa-miR1848,分別靶向編碼AP2,鋅指蛋白,水楊酸誘導(dǎo)蛋白19(SIP19),生長(zhǎng)素響應(yīng)因子(ARF)和NAC轉(zhuǎn)錄因子的基因,發(fā)現(xiàn)這些miRNAs可通過(guò)植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路參與調(diào)控葉片衰老。
此項(xiàng)研究成果為理解miRNA介導(dǎo)水稻葉片衰老提供了重要信息,并為水稻育種奠定了重要基礎(chǔ)。
*Xu X,Bai H,Liu C,Chen E,Chen Q,et al. (2014) Genome-Wide Analysis of MicroRNAs and Their Target Genes Related to Leaf Senescence of Rice. PLoS ONE 9(12): e114313.[
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