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《Nature Biotechnology》新技術增強了對染色質組織的認識
加州大學圣地亞哥分校表觀基因組學中心(C4E)的研究人員開發了一種名為“液滴Hi-C(Droplet Hi-C)”的新技術,該技術使科學家能夠快速確定染色質組織,即細胞內遺傳物質的排列。[查看]
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Cancer Cell:多組學分析揭示膠質瘤的共同特征
質母細胞瘤(GBM)及其他高級別的星形細胞瘤是最為常見且致命的腦部腫瘤,盡管經過了幾十年的基因組分析,其5年生存率仍徘徊在5%以下。近日,由圣路易斯華盛頓大學、太平洋西北國家實驗室等機構領導的研究團隊將蛋白質組學、代謝組學、脂質組學、翻譯后修飾與基因組學和轉錄組學分析結合起來,對高級別膠質瘤進行了全面分析,以揭示驅動癌癥的多尺度調控相互作用。[查看]
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最后一塊拼圖,人類Y染色體的完整序列首次公布
幾十年來,由于結構上的復雜性,Y染色體一直是基因組學界面臨的眾所周知的挑戰。現在,這個棘手的基因組區域終于被完全測序。端粒到端粒(T2T)聯盟的研究人員于本周在《Nature》雜志上發表了這項成果。這個聯盟由加州大學圣克魯斯分校生物分子工程學助理教授Karen Miga共同領導。目前,帶有注釋的完整Y染色體參考序列已發布在USUC Genome Browser上,也可通過Github訪問。[查看]
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Nat Genet:新方法揭示基因“增強子”的工作機理
來自日本理化研究所(RIKEN)綜合醫學科學中心和腫瘤分子研究所(IFOM)的研究人員與京都大學、卡羅林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起開發出了一種被稱為NET-CAGE的新技術,揭示了基因組中被稱為增強子的非編碼基因的結構,增強子可以激活特定基因的功能。基因組的這些部分曾經被認為是不重要的,被稱為"垃圾DNA",現在已知與各種疾病有關,了解它們的功能已經成為基因組學研究的一個重要目標.[查看]
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外泌體的應用——有機遇,也有挑戰
外泌體(exosome)是細胞分泌囊泡(extracellular vesicles)的一種亞型,存在于生物體液中,并參與多種生理和病理過程。外泌體被認為是細胞間通信的一種新機制,允許細胞交換蛋白質、脂質和遺傳物質。過去,細胞分泌的外泌體一度被認為只是參與廢物排泄;現在,隨著高通量蛋白質組學和基因組學的發展,外泌體被廣泛認為是生物體內細胞間短距離和長距離交流的高度保守的途徑,這種細胞間通信對于正常細胞和腫瘤細胞都是非常重要的。[查看]
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Sci Rep:鑒定出T細胞的炎性生物標志物
在一項新的研究中,來自美國馬歇爾大學藥學院和馬歇爾大學瓊-愛德華茲醫學基因組學核心學院的研究人員探究了人T細胞在炎癥條件下的功能。相關研究結果于2018年7月19日發表在Scientific Reports期刊上[查看]
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Genome Res:科學家開發出能對單細胞進行大規模分析的新型工具—BigSCale
近日,一項刊登在國際雜志Genome Research上的研究報告中,來自西班牙的研究人員通過研究提出了一種復雜的計算機框架來分析單細胞的基因表達水平,這一技術可以擴展到對數百萬個獨立的細胞進行分析處理,這項研究中,研究人員首次開發了一種工具來分析諸如大規模的單細胞RNA序列數據庫,這或能極大地擴展單細胞基因組學的研究范圍。[查看]
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Cell Rep:科學家發現一種新型的機體免疫系統調節因子
研究者Riitta Lahesmaa教授說道,我們發現,名為HIC1(Hypermethylated In Cancer 1)的蛋白質或許充當了調節性T細胞的關鍵調節子,能夠幫助控制促進T細胞功能發揮的大量基因進行表達;此外,研究人員還利用全基因組學的技術進行研究發現,HIC1能夠結合到細胞核的特殊位點上,而這些位點中經常含有和免疫介導性疾病相關的遺傳突變。[查看]
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Science子刊:利用RNAi盒培育出不含黃曲霉素的轉基因玉米
如今,在培育不含黃曲霉素的玉米的過程中,來自美國亞利桑那大學和亞利桑那州基因組學研究所的研究人員開發出一種靶向真菌基因aflC 上的三個區域的RNA干擾盒。當被轉染進玉米中時,這種RNAi盒降低被黃曲霉菌感染的玉米粒中的基因aflC表達,從而降低真菌黃曲霉素產生。[查看]
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基因+人工智能,Deep Genomics將會把精準醫療帶往何處?
Deep Genomics就是人工智能和基因組學聯姻的產物,即“Deep Learning + Genomics”。在用深度學習研究基因組學的時代,Deep Genomics推開了第一扇窗。[查看]
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單分子實時測序于海洋生物<font color='red'>基因組學</font>研究應用
自從末端終止法測序技術發明以來,DNA測序技術在短短三十余年內得到迅速發展,科學家們已經向著人類千元(1000 美元)基因組時代發起沖擊。最初由于高昂測序成本的限制,全基因組測序涉及的領域受到限制,只有細菌等基因組很小的生物的全基因組被首先測定,線蟲、果蠅、擬南芥等模式生物的基因組隨后被測定,人類基因組計劃的實施推動了基因組學在全世界的快速發展。這些測序工作都是采用Sanger法進行,項目實施耗時費力。隨著新一代測序技術(Next-generation sequencing, NGS)的出現,越來越多[查看]
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供應Sciencell原代細胞
原代細胞不僅廣泛應用于分子、細胞生物學和生物醫學基礎研究,如蛋白質組學、基因組學、細胞株(系)研究、DNA,RNA和遺傳學研究等,還可應用于當今熱門的生物醫藥產業如藥物篩選、藥物代謝和毒理研究、癌癥藥物的研究等。原代細胞在生物醫藥領域有不可替代性作用,市場前景廣闊。 除了部分終末分化的細胞,一般的細胞都能傳代6-8代及以上,有些細胞甚至更多,但是一般都建議客戶采用3-4代以內的細胞。在原代細胞培養過程中,一般是初次培養過夜后換液,以后每隔2-3天換一次液,以培養液的顏色為標準,一般變黃后就需換液。原代細胞的傳代前[查看]
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