"精準(zhǔn)醫(yī)療(Precision Medicine)"是基因檢測試劑和藥物研發(fā)的熱點(diǎn),指根據(jù)患者的遺傳信息和特異的疾病分子進(jìn)行準(zhǔn)確用藥。美國總統(tǒng)奧巴馬在2015及2016年國情咨文中分別發(fā)布了"精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃"和抗癌"登月計(jì)劃",該計(jì)劃的實(shí)施必將進(jìn)一步推動(dòng)腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療行業(yè)邁向高速發(fā)展時(shí)代。而腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃的加速推進(jìn),離不開基因檢測。
腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療基因檢測快速發(fā)展和不斷熱化的同時(shí),基因檢測規(guī)范化管理和檢測質(zhì)量等問題也受到越來越多的關(guān)注。2015年,歐洲分子基因診斷質(zhì)量聯(lián)盟(European Molecular Genetics Quality Network,EMQN,成立于1998年,位于英國曼徹斯特市圣瑪麗醫(yī)院,是一家為全球?qū)嶒?yàn)室提供外部質(zhì)量評(píng)估(EQA)服務(wù)的非營利性機(jī)構(gòu),致力于提高臨床分子遺傳學(xué)檢測質(zhì)量。)發(fā)起了一項(xiàng)國際室間質(zhì)量評(píng)價(jià)活動(dòng),旨在推動(dòng)各醫(yī)院和檢測機(jī)構(gòu)的腫瘤相關(guān)標(biāo)志物檢測規(guī)范化,并于同年12月11日公開發(fā)表其評(píng)價(jià)結(jié)果。
基因檢測規(guī)范化逐漸受到重視
2015年EMQN室間質(zhì)評(píng)活動(dòng)共有47個(gè)國家的321家醫(yī)院或?qū)嶒?yàn)室參評(píng),比去年新增15%;中國地區(qū)參與EMQN室間質(zhì)評(píng)活動(dòng)的醫(yī)院或?qū)嶒?yàn)室占比也從去年的32%提升至37%,呈現(xiàn)穩(wěn)步上升的趨勢。隨著基因檢測的進(jìn)一步發(fā)展,如何更好的進(jìn)行規(guī)范檢測也已得到國內(nèi)各醫(yī)療單位機(jī)構(gòu)的高度重視。通過參與國際室間質(zhì)評(píng)以及國內(nèi)室間質(zhì)評(píng),可以提高檢測工作質(zhì)量和管理水平,進(jìn)一步規(guī)范和提高各項(xiàng)目試驗(yàn)檢測能力。
我國基因檢測產(chǎn)品質(zhì)量與國際大牌產(chǎn)品無差異
在所有參與EGFR/KRAS/BRAF基因檢測實(shí)驗(yàn)室評(píng)比的315家醫(yī)院中,74.29%(231/315)采用商業(yè)試劑盒,其中,使用率最高的前三位分別為艾德生物(AmoyDx,中國:90/315,28.57%)、凱杰(Qiagen,德國:48/315,15.24%)和羅氏(Roche,瑞士:35/315,11.11%)。值得一提的是,在使用AmoyDx?試劑盒的90家實(shí)驗(yàn)室中,盡管各個(gè)實(shí)驗(yàn)室的操作環(huán)境不同,操作人員經(jīng)驗(yàn)各異,但對(duì)10例檢測樣本檢測出來的結(jié)果吻合率極高:總共有895例檢測結(jié)果與EMQN結(jié)果完全一致,檢測準(zhǔn)確率達(dá)99.4%。此外,全球321家參評(píng)醫(yī)院中有311家實(shí)驗(yàn)室使用了核酸提取產(chǎn)品,艾德生物以17.04%(53/311)的使用率位居第二,僅次于跨國公司Qiagen。由此可見,國產(chǎn)產(chǎn)品(如艾德生物)無論在使用率還是在檢測準(zhǔn)確率等方面都表現(xiàn)出與跨國公司Qiagen、Roche相媲美的實(shí)力。
多重基因檢測逐漸成為趨勢
從此次EMQN機(jī)構(gòu)提供的數(shù)據(jù)來看,多重基因的檢測比例逐步上升:近一半實(shí)驗(yàn)室(141家,45.3%)除檢測EGFR單基因突變外,還同時(shí)檢測BRAF、EGFR、KRAS、ALK、Ckit、HRAS、NRAS、PIK3CA、TP53等基因。可見多重基因檢測正逐漸獲得認(rèn)可并有望成為臨床基因檢測的主流趨勢。
NGS技術(shù)嶄露頭角,PCR技術(shù)仍是主流
今年參評(píng)的315家實(shí)驗(yàn)室,使用非商業(yè)試劑盒方法的有84家,其中有17家采用NGS技術(shù),占全部參評(píng)實(shí)驗(yàn)室5.4%(17/315),在非商業(yè)試劑盒方法中僅次于Sanger測序(27/315,8.57%),可見在多重基因檢測趨勢下,高通量測序技術(shù)開始嶄露頭角。但是由于NGS技術(shù)平臺(tái)可能出現(xiàn)的不確定因素:如擴(kuò)增和信號(hào)檢測問題,測序平臺(tái)特異的出錯(cuò)和糾錯(cuò)問題,生物信息學(xué)方面可能出現(xiàn)的問題,臨床驗(yàn)證程序和標(biāo)準(zhǔn)化問題等等,至今尚無獲批產(chǎn)品進(jìn)入臨床使用。從234家實(shí)驗(yàn)室使用的商業(yè)試劑盒的品牌技術(shù)來看,PCR技術(shù)依然是主流。
本文中分析的數(shù)據(jù)來自EMQN External Quality Assessment Scheme for Lung Cancer(2015)和EMQN External Quality Assessment Scheme for Lung Cancer(2014)
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