Science子刊：開發出一種檢測新冠病毒RNA的雙色RT-LAMP檢測方法

來源：作者：人氣：-發表時間：2020-09-28 09:57:00【大中小】

新型冠狀病毒SARS-CoV-2導致2019年冠狀病毒病（COVID-19），如今正在全球肆虐。基于此，人類面臨著一項重大的公共衛生挑戰。快速檢測現有的SARS-CoV-2感染和評估病毒傳播至關重要。

基于逆轉錄環介導等溫擴增（reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP）檢測病毒RNA的方法有潛力成為簡單、可擴展和廣泛適用的檢測方法。與基于逆轉錄定量聚合酶鏈反應（RT-qPCR）的方法相比，RT-LAMP檢測需要在恒溫下孵育，因此無需復雜的儀器設備。

在一項新的研究中，來自德國感染研究中心、德國癌癥研究中心和海德堡大學的研究人員使用了一組針對SARS-CoV-2 N基因的引物測試了用于檢測SARS-CoV-2病毒RNA的雙色RT-LAMP檢測方案。相關研究結果近期發表在Science Translational Medicine期刊上，論文標題為“A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples”。

這些作者從正在接受COVID-19測試的個體的768份咽拭子樣本中獲取多余的RNA樣本，并對這些樣本進行RT-LAMP檢測。他們測定了利用RT-LAMP檢測SARS-CoV-2病毒RNA的靈敏度和特異性。

與使用一組高靈敏的引物的RT-qPCR檢測方法相比，這些作者發現RT-LAMP檢測方法能可靠地檢測RT-qPCR測試時循環閾值（Ct）不超過30的SARS-CoV-2 RNA，靈敏度為97.5%，特異性為99.7%。

這些作者還開發了一種不需要事先進行RNA分離步驟的咽拭子直接RT-LAMP（swab–to–RT-LAMP）檢測方法，它保留了優良的特異性（99.5%），但比RT-LAMP檢測的靈敏度低（對RT-qPCR測試時Ct<30的咽拭子樣本而言，靈敏度為86%）。此外，這些作者開發了一種多重測序方法（LAMP-sequencing, LAMP測序）作為診斷驗證程序，以檢測和記錄RT-LAMP反應的結果。