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震驚!新冠病毒或一周突變一次,變異速度比此前估計的高50%以上

來源:生物探索作者:人氣:-發表時間:2021-09-01 09:01:00【
自新冠大流行以來,盡管全國已經采取多種措施遏制SARS-CoV-2傳播,但由于德爾塔、拉姆達等變異菌株糾纏不清,“曝光率”正日漸提高,使得全球疫情一次次陷入危機之中。
此前,有相關研究表明新冠病毒的變異速度為每兩周變異一次,然而近日,來自巴斯大學和愛丁堡大學的科研團隊發表于《Genome Biology and Evolution》雜志的一篇題為Causes and consequences of purifying selection on SARS-CoV-2的新研究似乎又讓人心涼了一截。
這項最新研究推翻了先前的研究成果,指出此前的研究忽略了大量已經發生但從未被測序的突變。事實上,SARS-CoV-2幾乎每周發生一次變異,變異速度比此前認為的高50%以上,未來,新型冠狀病毒“異軍”的出現速度或許會比我們想象得更快。
https://doi.org/10.1093/gbe/evab196
病毒的基因組在其增殖過程中不是一成不變的,在其復制過程中遺傳物質會出現復制“錯誤”現象,時時刻刻有突變的風險。然而,這種“風險”對于某些新冠病毒來說可能是好事,即“正面選擇”,它們通過變異來完善自己,讓自己進化,從而提高自己的傳染性。但也有少數新冠變異對病毒有害,發生“負面選擇”,會降低其生存率,使他們無法再人體內存活太久,因此當我們在進行新冠病毒測序計算病毒的突變速度時,無法及時捕捉到它們。
在這項最新的研究中,科研人員估計了不同核苷酸組成的四倍簡并位點(4DTv)的比率以評估基因組是否發生全基因組復制事件,并使用這些核苷酸依賴的比率來推斷真正的潛在突變率,從而推斷出缺失突變的比率。不僅如此,他們還利用生物信息學中最常見的Ka/Ks分析法推斷出新冠病毒可能“缺失”的突變比率,若Ka/Ks>1,則認為有正選擇效應,若 Ka/Ks<1,則認為有負面選擇作用。
綜合研究數據顯示,假如考慮到這些“隱身突變”,病毒的真實突變率至少比之前認為的高50%。因此為了降低突變速率,找到清除負面選擇的原因十分必要,研究人員發現,負面選擇大多源于可預測的原因,如變異使基因變短,或者使蛋白質(如刺突蛋白)功能不良等。
(四重簡并位點的過量變體意味著負向選擇)
此前,俄羅斯報道在一名患有淋巴瘤的女子體內曾檢測出18種變異的新冠病毒,首次確認了新冠病毒在生物體內長期存在會導致大量突變出現,這也警醒我們若人體的免疫系統難以控制病毒時,必須將其隔離,因為新冠病毒在人體內生存超過幾個星期,就有可能會進化,促成新的變異體,正如阿爾法變異毒株的誕生一樣。
但巴斯大學米爾納進化中心的勞倫斯·赫斯特教授表示:“我們也不必過分恐慌,新冠病毒在患者體內的進化幾率并不高,因為大多數人在病毒發生變異之前就已經將體內病毒清除。
未來,希望科研人員能早日找到遏制病毒傳播的有效機制,讓世界重新回到新冠病毒大流行之前的狀態,讓大家重新回歸正常的生活。
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此文關鍵字:新冠病毒 變異