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震驚!新冠病毒或一周突變一次,變異速度比此前估計(jì)的高50%以上

來(lái)源:生物探索作者:人氣:-發(fā)表時(shí)間:2021-09-01 09:01:00【
自新冠大流行以來(lái),盡管全國(guó)已經(jīng)采取多種措施遏制SARS-CoV-2傳播,但由于德?tīng)査⒗愤_(dá)等變異菌株糾纏不清,“曝光率”正日漸提高,使得全球疫情一次次陷入危機(jī)之中。
此前,有相關(guān)研究表明新冠病毒的變異速度為每?jī)芍茏儺愐淮危欢眨瑏?lái)自巴斯大學(xué)和愛(ài)丁堡大學(xué)的科研團(tuán)隊(duì)發(fā)表于《Genome Biology and Evolution》雜志的一篇題為Causes and consequences of purifying selection on SARS-CoV-2的新研究似乎又讓人心涼了一截。
這項(xiàng)最新研究推翻了先前的研究成果,指出此前的研究忽略了大量已經(jīng)發(fā)生但從未被測(cè)序的突變。事實(shí)上,SARS-CoV-2幾乎每周發(fā)生一次變異,變異速度比此前認(rèn)為的高50%以上,未來(lái),新型冠狀病毒“異軍”的出現(xiàn)速度或許會(huì)比我們想象得更快。
https://doi.org/10.1093/gbe/evab196
病毒的基因組在其增殖過(guò)程中不是一成不變的,在其復(fù)制過(guò)程中遺傳物質(zhì)會(huì)出現(xiàn)復(fù)制“錯(cuò)誤”現(xiàn)象,時(shí)時(shí)刻刻有突變的風(fēng)險(xiǎn)。然而,這種“風(fēng)險(xiǎn)”對(duì)于某些新冠病毒來(lái)說(shuō)可能是好事,即“正面選擇”,它們通過(guò)變異來(lái)完善自己,讓自己進(jìn)化,從而提高自己的傳染性。但也有少數(shù)新冠變異對(duì)病毒有害,發(fā)生“負(fù)面選擇”,會(huì)降低其生存率,使他們無(wú)法再人體內(nèi)存活太久,因此當(dāng)我們?cè)谶M(jìn)行新冠病毒測(cè)序計(jì)算病毒的突變速度時(shí),無(wú)法及時(shí)捕捉到它們。
在這項(xiàng)最新的研究中,科研人員估計(jì)了不同核苷酸組成的四倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)(4DTv)的比率以評(píng)估基因組是否發(fā)生全基因組復(fù)制事件,并使用這些核苷酸依賴的比率來(lái)推斷真正的潛在突變率,從而推斷出缺失突變的比率。不僅如此,他們還利用生物信息學(xué)中最常見(jiàn)的Ka/Ks分析法推斷出新冠病毒可能“缺失”的突變比率,若Ka/Ks>1,則認(rèn)為有正選擇效應(yīng),若 Ka/Ks<1,則認(rèn)為有負(fù)面選擇作用。
綜合研究數(shù)據(jù)顯示,假如考慮到這些“隱身突變”,病毒的真實(shí)突變率至少比之前認(rèn)為的高50%。因此為了降低突變速率,找到清除負(fù)面選擇的原因十分必要,研究人員發(fā)現(xiàn),負(fù)面選擇大多源于可預(yù)測(cè)的原因,如變異使基因變短,或者使蛋白質(zhì)(如刺突蛋白)功能不良等。
(四重簡(jiǎn)并位點(diǎn)的過(guò)量變體意味著負(fù)向選擇)
此前,俄羅斯報(bào)道在一名患有淋巴瘤的女子體內(nèi)曾檢測(cè)出18種變異的新冠病毒,首次確認(rèn)了新冠病毒在生物體內(nèi)長(zhǎng)期存在會(huì)導(dǎo)致大量突變出現(xiàn),這也警醒我們?nèi)羧梭w的免疫系統(tǒng)難以控制病毒時(shí),必須將其隔離,因?yàn)樾鹿诓《驹谌梭w內(nèi)生存超過(guò)幾個(gè)星期,就有可能會(huì)進(jìn)化,促成新的變異體,正如阿爾法變異毒株的誕生一樣。
但巴斯大學(xué)米爾納進(jìn)化中心的勞倫斯·赫斯特教授表示:“我們也不必過(guò)分恐慌,新冠病毒在患者體內(nèi)的進(jìn)化幾率并不高,因?yàn)榇蠖鄶?shù)人在病毒發(fā)生變異之前就已經(jīng)將體內(nèi)病毒清除。
未來(lái),希望科研人員能早日找到遏制病毒傳播的有效機(jī)制,讓世界重新回到新冠病毒大流行之前的狀態(tài),讓大家重新回歸正常的生活。
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