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二代奧密克戎問世!變異多、傳播快,BA.2.75來勢洶洶

來源:生物探索作者:人氣:-發表時間:2022-07-07 10:16:00【
摘要:截至7月2日,各國研究人員在全球最大的流感及新型冠狀病毒數據平臺“GISAID”(Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data)等國際新冠病毒基因組數據庫中共提交了85個BA.2.75變種的基因序列。這種編號為“BA.2.75”的奧密克戎毒株新型變種引發各國科學家的高度關注。
7月3日,根據以色列病毒學實驗室研究員Shay Fleishon獲取的序列信息,印度有10個邦或已出現奧密克戎變異毒株BA.2.75,該變種最早發現于來自印度的基因序列,之后迅速在英國、美國、日本、加拿大、澳大利亞、新西蘭、德國等其他7個國家相繼出現。
Shay Fleishon公開平臺發文
圖1 Shay Fleishon公開平臺發文(圖源:twitter)
■ BA.2.75或成首個成功突變的“第二代變種”
根據Shay Fleishon等人的解釋,第二代變種是指由第一代變種進化而來,但具有突變較多、差異較大等特點的變種。對奧密克戎毒株來說,BA.1、BA.2、BA.3、BA.4、BA.5等變種屬于“第一代變種”,而BA.2.75則可能成為首個“第二代變種”。關于新冠病毒進化枝的發育圖可參考圖2。
新冠病毒進化枝的系統發育圖
圖2 新冠病毒進化枝的系統發育圖(圖源:[2])
Shay Fleishon表示,在BA.2.75之前,研究人員已經發現了很多的新冠病毒的“第二代變種”,但最終發現這些二代變種都沒能大范圍傳播,導致樣本量很少。但是,此次突變的BA.2.75已在多個不同國家傳播開來,或能成為首個成功突變的“第二代變種”。BA.2.75代表著奧密克戎毒株的進一步進化,未來可能會出現更復雜的基因突變。
■ 傳播速度快!BA.2.75未來或掀起新疫情
此前的研究表明,奧密克戎毒株BA.2變種的傳染性強于更早出現的BA.1變種。去年年底,奧密克戎毒株BA.1變種在全球掀起一輪空前的疫情高峰;今年3-4月間,BA.2逐步“取代”BA.1導致美國、歐洲等國進入另一輪疫情;進入6月后,BA.4、BA.5變種的擴散使歐洲、以色列等地疫情再度加劇。
作為“第二代變種”,BA.2.75擁有眾多“不尋常”的突變,其傳染速度較快,或可突破現有疫苗和毒株感染構建的免疫屏障。有專家表示,該變種可替代BA.2、BA.4等現有變種,在全球掀起新的疫情高峰。倫敦帝國理工學院病毒學家Tom Peacock稱,第二代變種BA.2.75從已經存在的、成功的變種中突變而來,這種新變種毒株有多重尖峰突變,傳播性強,更具威脅性,需要對其保持“密切關注”。
30年來,全世界已經花費了170多億美元,努力通過接種疫苗運動根除該病毒。2020年底,世衛組織緊急批準了一種名為nOPV2的改良疫苗,以阻止非洲和東地中海國家流行的疫苗衍生脊髓灰質炎病毒的暴發。疫苗中的病毒經過了基因改造,以防止其變得有害。
根據全球根除脊髓灰質炎全球行動計劃,自2021年3月以來,已有15個國家接種了3億多劑nOPV2疫苗。在華盛頓西雅圖的比爾和梅琳達·蓋茨基金會進行脊髓灰質炎研究的公共衛生流行病學家Ananda Bandyopadhyay說,這種疫苗“是一種令我們都非常興奮的工具”。
Tom Peacock公開平臺發文
圖3 Tom Peacock公開平臺發文(圖源:twitter)
澳大利亞數據處理專家Michael?Horney認為,BA.2.75傳播速度極快,6月15日至30日間,該變種占印度上傳的基因組樣本的比例由不到5%迅速上升到18%,正在快速取代其他變種,其傳播速度比BA.2、BA.5變種似乎都要快。
奧密克戎變異毒株BA.2.75最早發現于來自印度的基因序列
圖4 奧密克戎變異毒株BA.2.75最早發現于來自印度的基因序列
專家表示,除了奧密克戎變體中已經存在的突變之外,BA.2.75變體還包括刺突蛋白中的新突變。在這些突變中,G446S和R493Q尤其值得關注,因為它賦予了變體逃避幾種抗體的能力。這意味著它可以感染已接種疫苗或以前曾被感染的人。截至目前,BA.2.75的抗體逃逸似乎與當前疫苗的BA.4/5相似。研究表明,R493Q突變增加了病毒附著在ACE2上的能力(注:ACE2是可以幫助新冠病毒進入細胞的蛋白質)[1]。
目前已獲取85個BA.2.75的基因序列,主要來自印度10個邦和其它7個國家。日本、德國、英國、加拿大、美國、澳大利亞和新西蘭已出現BA.2.75毒株病例。由于各國共享的新冠病毒基因組數量僅為全球新冠病例數的“冰山一角”,因此感染BA.2.75變種的實際人數要遠大于實際播報人數。
Fleishon表示,現階段預測BA.2.75毒株是否會成為下一個主流變種病毒還為時過早,但BA.2.75的出現“令人震驚”,因為它可能暗示著新一波新冠疫情即將到來。
參考資料:
[1]https://www.dnaindia.com/health/report-what-we-know-so-far-about-omicron-ba-2-75-sub-variant-spreading-18-percent-more-covid-19-delta-2966072
[2]https://master.clades.nextstrain.org/

 

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