Science子刊：發(fā)現(xiàn)經(jīng)常突變的癌蛋白的空間染色體組織的新作用

來源：作者：人氣：-發(fā)表時(shí)間：2019-05-29 09:24:00【大中小】

威斯達(dá)研究所的一項(xiàng)新研究揭示了蛋白質(zhì)ARID1A的功能，該蛋白由一種基因編碼，這種基因是人類癌癥中最常見的突變之一。根據(jù)發(fā)表在《Science Advances》上的這項(xiàng)研究，ARID1A在基因組的空間組織中發(fā)揮著作用；因此，它的缺失對整體的基因表達(dá)具有廣泛的影響。這一發(fā)現(xiàn)為破譯與幾種癌癥特別是卵巢癌相關(guān)的分子變化提供了重要信息。

"我的實(shí)驗(yàn)室一直在研究ARID1A作為SWI/SNF復(fù)合物的一部分在基因表達(dá)調(diào)控中的作用，"Wistar研究所癌癥中心副主任、首席研究員、基因表達(dá)調(diào)控項(xiàng)目的教授兼聯(lián)合項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Rugang Zhang博士說。"在我們尋找這種復(fù)合物的新相互作用蛋白的過程中，我們發(fā)現(xiàn)了一種新的蛋白質(zhì)，它為ARID1A作為空間染色體組織的全基因組調(diào)節(jié)劑的功能提供了新的視角。"

Science子刊：發(fā)現(xiàn)經(jīng)常突變的癌蛋白的空間染色體組織的新作用

基因組的三維結(jié)構(gòu)決定了DNA分子如何在一個(gè)微觀空間中堆積，同時(shí)也允許每個(gè)基因在適當(dāng)?shù)臅r(shí)間進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。研究小組發(fā)現(xiàn)，ARID1A與凝素II復(fù)合物的一個(gè)組分相互作用，后者通過組織染色體結(jié)構(gòu)來調(diào)控基因表達(dá)。

Zhang補(bǔ)充說："這是一個(gè)精細(xì)調(diào)控的過程，我們發(fā)現(xiàn)ARID1A在其中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。"

結(jié)果表明ARID1A決定了凝血酶II在某些稱為增強(qiáng)子的DNA調(diào)控元件上的基因組定位。因此，當(dāng)ARID1A功能因基因突變而喪失時(shí)，凝縮素II的分布發(fā)生改變，大量基因的表達(dá)也隨之改變。

Zhang和他的同事還發(fā)現(xiàn)，通過與凝縮素II的相互作用，ARID1A控制著染色體的不同部分如何在空間上組織在一起，這些區(qū)域被稱為染色體區(qū)域，有助于某些基因的協(xié)調(diào)表達(dá)。

"我們的發(fā)現(xiàn)為癌癥中的染色質(zhì)調(diào)控領(lǐng)域增加了一個(gè)重要的部分，"該研究的第一作者之一、Zhang博士實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員Shuai Wu博士說。"通過改變?nèi)旧w的特殊結(jié)構(gòu)，ARID1A基因的缺失對基因表達(dá)的影響將比我們最初認(rèn)為的要廣泛得多。"

參考資料：

Shuai Wu et al.ARID1A spatially partitions interphase chromosomes" Science Advances (2019). DOI： 10.1126/sciadv.aaw5294

advances.sciencemag.org/content/5/5/eaaw5294/tab-figures-data